菏泽市工贸中等专业学校重视多方合作，与菏泽家政职业学院、中航国铁教育集团、白鹭航空有限公司、京东济南分公司、时光坐标集团、曹县人民医院、云龙木雕等企业签署了校校合作、校企合作合同，各专业结合自身特点，与企业共同制定培养方案，共同研发课程，为师生搭建发展平台，为社会培养高素质技能人才，服务地方经济。
菏泽市工贸中等专业学校坚持“从严治教、从严治学、从严治校”的原则，实行全封闭式管理，坚持24小时校长带班制，加强食品安全管理，确保学生在校安全。